16 de noviembre de 2017.

Dra. Liliana Pardo López, Investigador Titular B, Instituto de Biotecnología de la UNAM campus Cuernavaca.

Resumen

El Golfo de México es un sistema complejo que alberga una gran cantidad de microorganismos nuevos, cuyo conocimiento y caracterización puede generar nuevas herramientas de uso biotecnológico. Para ello, hemos realizado seis cruceros oceanográficos obteniendo muestras de columna de agua y sedimento marino de 232 estaciones en el Suroeste del Golfo de México. A partir de estas muestras ambientales hemos obtenido el DNA tanto de la muestra original como de cultivos en distintos medios para posteriormente llevar a cabo su secuenciación utilizando plataformas de secuenciación masiva. Las secuencias provenientes de lecturas realizadas a partir de shotgun y de amplicones de 16S, nos han permitido realizar la asignación taxonómica de 145 estaciones, obteniendo de esta forma una línea base de la biodiversidad y abundancia relativa de las bacterias que habitan el Golfo de México. El proyecto también contempla el cultivo y caracterización de microorganismos aislados y consorcios que habitan cerca de las plataformas de extracción de petróleo, lo cual nos permite la búsqueda de nuevos genes y enzimas que están involucrados en actividades con potencial biotecnológico, como la degradación de hidrocarburos. Dichas búsquedas se realizan a partir de genotecas y metagenotecas dirigidas construidas con el metagenoma de consorcios bacterianos.

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